背景：新辅助化疗是一种治疗乳腺癌患者的有效措施。但是，有些患者却因为化疗耐药而无法从中获益。截止目前，能够提高乳腺癌新辅助化疗敏感性的方法依旧很缺乏。已有研究报道微小 RNA 参与了恶性肿瘤的发生发展（包括耐药）。
方法：首先，我们从 GEO 数据库中下载 GSE73736。接着，通过t检验得到差异表达的微小 RNA。随后，miRTarbase 数据库用于预测微小 RNA 的靶基因。然后，我们用 DAVID 网站对这些靶基因进行 GO 功能注释和 KEGG 通路富集分析。通过 STRING 数据库和 Cytoscape 软件，我们进一步构建蛋白互作网络图和枢纽基因-微小 RNA 网络图。下一步，我们测定具有潜能的微小 RNA 在乳腺癌细胞系和组织标本中的表达量。最后，我们检测三个微小 RNA（miR-3617-3p，miR-3136-3P，miR-520b）调控乳腺癌耐药的作用。
结果：通过比较乳腺癌新辅助化疗耐药和敏感组中微小 RNA 的表达量，我们发现 123 个差异表达微小 RNA（包括 60 个上调的微小 RNA 和 63 个下调的微小 RNA）。617 和 1,146 个靶基因被预测。这些靶基因富集在肿瘤相关或者化疗耐药相关的通路，例如：MAPK 信号通路，Wnt 信号通路和 p53 信号通路。MAPK1  和 PRDM10  是两个最重要的枢纽基因。我们通过构建枢纽基因-微小 RNA 网络发现 50 个枢纽基因可以被 16 个微小 RNA 调控。miR-3617-3p 和 miR-3136-3p 在两株乳腺癌耐药细胞中上调，而 miR-520b 在两株乳腺癌耐药细胞中下调。TCGA 数据表明 miR-3136-3p 和 miR-520b 分别在乳腺癌细胞中上调和下调。功能实验证实 miR-3136-3p 和 miR-3617-3p 可以减少乳腺癌敏感性而 miR-520b 却可以逆转化疗耐药。
结论：当前这个基于生物信息学分析和实验验证的研究揭露乳腺癌新辅助化疗耐药的新机制。 
Keywords: breast cancer, chemoresistance, neoadjuvant chemotherapy miRNA, bioinformatics analysis, enrichment analysis