背景和目的：选择性多聚腺苷酸化（alternative polyadenylation, APA）是一种在真核生物中重要的转录后调控机制。它在细胞的增殖与分化以及癌症等多个生物学过程及疾病中发挥着重要的作用。结肠癌（colorectal cancer, CRC）是世界范围内最为常见的恶性肿瘤之一，在中国的发病率及死亡率均排在恶性肿瘤前五位。本研究通过分析癌症组织和癌旁正常组织全基因组水平的 APA，研究了参与 CRC 细胞调控的3’非翻译区（3’UTR）发生变化的基因。
方法：利用实验室自主研发并优化的 3T-seq 实验技术，从全基因组范围研究了结肠癌中选择性多聚腺苷酸的分布状况。该研究以临床结肠癌病人的癌症组织及其癌旁正常组织为样品，进行了 3’UTR 标签文库的构建及高通量测序。利用生物信息学的方法完成了癌症组织和对应的正常组织的 APA 谱图的绘制，并选取其中一个代表性的基因 GPI  进行了 qRT-PCR 的验证。
结果：本研究共鉴定出 35,076 个 poly(A) 位点。与对应的正常组织相比，在 3 个病人的癌组织中分别有 350、305 和 375 个基因发生了显著的由 APA 介导的 3’UTR 长度的变化。共有 47 个基因在 3 个病人中均发生了显著的 3’UTR 长度变化，其中 3’UTR 变短的基因占多数，分别为 277 个（79.1%）、357 个（87.9%）和 189 个（50.4%），且部分基因同癌症有关，例如 GPI 。
结论：从全基因组范围系统性地绘制了结肠癌 APA 图谱，并发现了一些新的在 CRC 病人中 3’UTR 长度发生变化的基因，丰富了结肠癌 APA 的研究。
关键词：选择性多聚腺苷酸化；结直肠癌；3T-seq；3’UTR