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在乳腺癌中活化 T 细胞的分子机制
Authors Wu J, Li M, Zhang Y, Cai Y, Zhao G
Received 3 May 2018
Accepted for publication 18 June 2018
Published 20 August 2018 Volume 2018:11 Pages 5015—5024
DOI https://doi.org/10.2147/OTT.S173018
Checked for plagiarism Yes
Review by Single-blind
Peer reviewers approved by Dr Manfred Beleut
Peer reviewer comments 3
Editor who approved publication: Dr Federico Perche
背景:本研究旨在探讨活化 T 细胞对乳腺癌细胞的作用,为乳腺癌细胞与免疫细胞的相互作用机制研究提供理论依据。
方法:从 Gene Expression Omnibus 数据库下载微阵列数据集 GSE73527。在 MDA-MB-231 细胞和 MCF7 细胞活化的人 T 细胞之间分别鉴定了共同的差异表达 mRNAs(co-DEMs)和共同的差异表达的长非编码 RNAs(co-DElncRNAs)。构建了 RNA-miRNA-lncRNA(ceRNA)网络。此外,对 co-DEMs 进行 KEGG 通路和 GO 功能分析。构建了蛋白质—蛋白质相互作用(PPI)网络和模块。
结果:该研究中共检测到 639 个 co-DEMs(例如白细胞介素-6(IL6 )和信号转导和转录激活因子 1(STAT1 ))。对其他生物的防御反应和单纯疱疹感染分别是 co-DEMs 富集得到的最突出的功能和通路。进一步构建了一个 PPI 网络和 3 个模块。在 ceRNA 网络中总共探索了 88 个 mRNA-miRNA-lncRNA 关系,例如 BTN3A1 -has-mir-20b-5p-HCP5 。
结论:活化的 T 细胞可能通过上调 IL6 和 STAT1 ,在对其他生物的防御反应功能和单纯疱疹感染通路中起关键作用,进一步影响了乳腺癌的进展。 BTN3A1 -has-miR-20b-5p-HCP5 关系可能是乳腺癌细胞与免疫细胞之间潜在的相互作用机制。
关键词:乳腺癌;差异表达 mRNA;功能和通路分析;蛋白质—蛋白质相互作用网络;mRNA-miRNAs-lncRNA 调控网络