已发表论文

在乳腺癌中活化 T 细胞的分子机制

 

Authors Wu J, Li M, Zhang Y, Cai Y, Zhao G

Received 3 May 2018

Accepted for publication 18 June 2018

Published 20 August 2018 Volume 2018:11 Pages 5015—5024

DOI https://doi.org/10.2147/OTT.S173018

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Editor who approved publication: Dr Federico Perche

背景:本研究旨在探讨活化 细胞对乳腺癌细胞的作用,为乳腺癌细胞与免疫细胞的相互作用机制研究提供理论依据。
方法:从 Gene Expression Omnibus 数据库下载微阵列数据集 GSE73527。在 MDA-MB-231 细胞和 MCF7 细胞活化的人 细胞之间分别鉴定了共同的差异表达 mRNAsco-DEMs)和共同的差异表达的长非编码 RNAsco-DElncRNAs)。构建了 RNA-miRNA-lncRNAceRNA)网络。此外,对 co-DEM进行 KEGG 通路和 GO 功能分析。构建了蛋白质—蛋白质相互作用(PPI)网络和模块。
结果:该研究中共检测到 639 个 co-DEMs(例如白细胞介素-6IL6 )和信号转导和转录激活因子 1STAT1 ))。对其他生物的防御反应和单纯疱疹感染分别是 co-DEM富集得到的最突出的功能和通路。进一步构建了一个 PPI 网络和 个模块。在 ceRNA 网络中总共探索了 88 个 mRNA-miRNA-lncRNA 关系,例如 BTN3A1 -has-mir-20b-5p-HCP5 
结论:活化的 细胞可能通过上调 IL6  和 STAT1 ,在对其他生物的防御反应功能和单纯疱疹感染通路中起关键作用,进一步影响了乳腺癌的进展。 BTN3A1 -has-miR-20b-5p-HCP5  关系可能是乳腺癌细胞与免疫细胞之间潜在的相互作用机制。
关键词:乳腺癌差异表达 mRNA功能和通路分析蛋白质—蛋白质相互作用网络;mRNA-miRNAs-lncRNA 调控网络




Figure 2 Venn diagram and heat map of co-DEMs between groups.