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通过全基因组规模分析鉴定微小 RNA 生物标志物用于预测早期胰腺导管腺癌患者胰腺十二指肠切除术后的预后

 

Authors Liao X, Wang X, Huang K, Yang C, Yu T, Han C, Zhu G, Su H, Huang R, Peng T

Received 15 March 2018

Accepted for publication 14 May 2018

Published 10 August 2018 Volume 2018:10 Pages 2537—2551

DOI https://doi.org/10.2147/CMAR.S168351

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Editor who approved publication: Professor Kenan Onel

背景:该研究的目的是使用来自癌症基因组图谱(TCGA)的 miRNA 测序(miRNA-seq)数据,研究胰十二指肠切除术后早期胰腺导管腺癌(PDAC)患者的潜在预后 microRNAmiRNA)生物标志物。分离出基于 miRNA 表达的预后特征,并且探讨这些 miRNA 的靶基因在 PDAC 患者的总体存活(OS)中的潜在作用。
材料与方法:112 名接受胰十二指肠切除术治疗的 PDAC 患者的 miRNA-seq 数据集从 TCGA 获得的。进行生存分析以鉴定潜在的预后生物标志物。
结果:使“step”函数筛选出 11 个 miRNAhsa-mir-501hsa-mir-4521hsa-mir-5091hsa-mir-24-1hsa-mir-126hsa-mir-30ehsa-mir-3157hsa -let-7a-3hsa-mir-133a-1hsa-mir-4709 和 hsa-mir-421)用于构建预后特征。11-miRNA 构成的预后特征在预后预测中表现良好(矫正后 P <0.0001,矫正后风险比= 4.285, 95% 置信区间= 2.146-8.554),时间依赖性 ROC 分析提示 年,年和 年 PDAC OS 预测的曲线下面积分别为 0.864, 0.877 和 0.787。综合生存分析表明,预后标志可作为 PDAC OS 的独立预后因素,与其他传统临床指标相比,预后预测效果更好。 miRNA 靶基因的功能评估表明它们在多种生物过程和途径中显著富集,包括细胞增殖,细胞周期生物学过程,FoxOMAPKJAK-STAT 信号通路。癌症通路和 ErbB 信号通路。这些 miRNA 的多个靶基因也与 PDAC 的 OS 相关。
结论:本研究鉴定了一种新的 miRNA 表达特征,该特征在胰十二指肠切除术后表现出作为 PDAC 预后生物标志物的潜力。
关键词:microRNA、预后、胰腺导管腺癌、TCGA、胰十二指肠切除术




Figure 6 Interaction networks of the prognostic miRNAs and their target genes.