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Authors Liao X, Wang X, Huang K, Yang C, Yu T, Han C, Zhu G, Su H, Huang R, Peng T
Received 15 March 2018
Accepted for publication 14 May 2018
Published 10 August 2018 Volume 2018:10 Pages 2537—2551
DOI https://doi.org/10.2147/CMAR.S168351
Checked for plagiarism Yes
Review by Single-blind
Peer reviewers approved by Dr Colin Mak
Peer reviewer comments 4
Editor who approved publication: Professor Kenan Onel
背景:该研究的目的是使用来自癌症基因组图谱(TCGA)的 miRNA 测序(miRNA-seq)数据,研究胰十二指肠切除术后早期胰腺导管腺癌(PDAC)患者的潜在预后 microRNA(miRNA)生物标志物。分离出基于 miRNA 表达的预后特征,并且探讨这些 miRNA 的靶基因在 PDAC 患者的总体存活(OS)中的潜在作用。
材料与方法:112 名接受胰十二指肠切除术治疗的 PDAC 患者的 miRNA-seq 数据集从 TCGA 获得的。进行生存分析以鉴定潜在的预后生物标志物。
结果:使“step”函数筛选出 11 个 miRNA(hsa-mir-501,hsa-mir-4521,hsa-mir-5091,hsa-mir-24-1,hsa-mir-126,hsa-mir-30e,hsa-mir-3157,hsa
-let-7a-3,hsa-mir-133a-1,hsa-mir-4709 和 hsa-mir-421)用于构建预后特征。11-miRNA 构成的预后特征在预后预测中表现良好(矫正后 P <0.0001,矫正后风险比= 4.285, 95% 置信区间= 2.146-8.554),时间依赖性 ROC 分析提示 1 年,2 年和 3 年 PDAC OS 预测的曲线下面积分别为 0.864, 0.877 和 0.787。综合生存分析表明,预后标志可作为 PDAC OS 的独立预后因素,与其他传统临床指标相比,预后预测效果更好。 miRNA 靶基因的功能评估表明它们在多种生物过程和途径中显著富集,包括细胞增殖,细胞周期生物学过程,FoxO,MAPK,JAK-STAT 信号通路。癌症通路和 ErbB 信号通路。这些 miRNA 的多个靶基因也与 PDAC 的 OS 相关。
结论:本研究鉴定了一种新的 miRNA 表达特征,该特征在胰十二指肠切除术后表现出作为 PDAC 预后生物标志物的潜力。
关键词:microRNA、预后、胰腺导管腺癌、TCGA、胰十二指肠切除术