背景：本研究的目的是鉴定与乙型肝炎病毒（HBV）相关肝细胞癌（HCC）中肿瘤蛋白 p53（TP53）表达状态相关的候选单核苷酸多态性（SNPs）和分子通路，阐明其潜在机制并产生 SNP 到基因到通路的假说。
材料与方法：根据我们之前在 387 例 HBV 相关 HCC 患者中的 TP53 表达状态的全基因组关联研究的结果，使用 ICSNPathway 进行通路分析。
结果：通过 ICSNPathway 通路分析，我们确定了 18 个候选 SNP 和 10 个候选通路与 HBV 相关 HCC 中 TP53 表达状态相关。最强的机制涉及主要组织相容性复合体II类，DPβ1（人类白细胞抗原 [HLA ]-DPB1 -rs1042153），主要组织相容性复合体 II 类，DQβ1（HLA -DQB1 -rs1130399，HLA -DQB1 -rs1049056，HLA -DQB1 -rs1049059 和 HLA -DQB1 -rs1049060）和主要组织相容性复合体 II 类 DRβ1（HLA -DRB1 -rs35445101）的调节。 这些 SNP 影响除造血细胞谱系通路之外的所有候选通路中的调节作用。使用 GSE14520 数据集，GeneMANIA 和 STRING 进行关联分析表明所有候选 SNP 所在的基因都与 TP53  相关联。生存分析显示，TP53 阴性状态的 COL6A3 -rs111231885 和 COL6A3 -rs113155945 和 COL6A3  模块 4 的 CC 单体型可能对肝切除术后 HBV 相关 HCC 患者有保护作用。
结论： 我们的通路分析鉴定了 18 个候选 SNP 和 10 个候选通路与 HBV 相关 HCC 中的 TP53 表达状态相关。在这些候选 SNP 中，COL6A3  的遗传变异可能是 HBV 相关 HCC 的潜在预后生物标志物。
关键词：TP53、肝细胞癌、乙型肝炎病毒、全基因组关联分析、通路分析