Yuyan Wang,1,* Huanran Zhang,2,* Yi Liu,3 Yifei Wang1 

1Department of Emergency Medicine, Zhuji Traditional Chinese Medicine Hospital, Zhuji, People’s Republic of China; 2Department of Emergency Medicine, the First Affiliated Hospital, Zhejiang University School of Medicine, Hangzhou, People’s Republic of China; 3Collaborative Innovation Center for Diagnosis and Treatment of Infectious Diseases, State Key Laboratory for Diagnosis and Treatment of Infectious Diseases, the First Affiliated Hospital, Zhejiang University School of Medicine, Hangzhou, People’s Republic of China

*These authors contributed equally to this work

Correspondence: Yifei Wang, Email doctor_wyf1120@163.com
摘要

目的　粘质沙雷菌（Serratia marcescens）是一种重要的条件致病菌，广泛引起医院感染，且耐药问题日益严峻。携带bla_KPC-2基因的菌株可产生碳青霉烯酶，导致对碳青霉烯类抗生素耐药，严重限制临床治疗选择，构成重大公共卫生威胁。本研究旨在对一株从粪便样本中分离的同时携带bla_KPC-2与bla_CTX-M-14基因的ST595型粘质沙雷菌L4843进行全基因组测序与分子特征分析，探究其耐药基因的遗传背景及传播潜力。

方法　采用肉汤微量稀释法测定菌株的药物敏感性。结合Illumina NovaSeq与Nanopore三代测序技术进行全基因组测序，并利用Unicycler进行混合组装，获得完整基因组序列。通过生物信息学工具鉴定耐药基因、质粒类型及可移动遗传元件。以大肠埃希菌J53为受体菌，通过接合转移实验评估耐药质粒的可转移性，PCR验证接合子中耐药基因的存在。

结果　菌株L4843基因组全长为5,377,884 bp，GC含量为59.8%。基因组分析显示其携带多种β-内酰胺类耐药基因，包括bla_KPC-2、bla_CTX-M-14、bla_SRT-1、bla_LAP-2。其中，bla_KPC-2定位于一个repB(R1701)型质粒上，该质粒富含IS26、ISKpn19等插入序列及TnAs1转座子，提示其具有高度重组潜力。序列比对分析显示，该质粒与GenBank中已报道的质粒序列（CP047692、CP047686、MT269826）具有高度同源性，且bla_KPC-2所在区域结构高度保守，提示存在共同的水平传播机制。接合实验成功获得耐药接合子，证实该质粒具备接合转移能力。