刘婷婷 郑帅 贾立昕 杜杰 朴春梅 

北京市心肺血管疾病研究所，教育部心血管重塑相关疾病重点实验室，心血管重大疾病防治省部共建协同创新中心，首都医科大学附属北京安贞医院

摘要

目的：基于长链非编码 RNA（lncRNA）-信使 RNA（mRNA）表达谱，探讨CXCL16分子相关的烟曲霉提取物诱导小鼠哮喘模型中抗原呈递的调控机制。

方法：通过气管内滴注烟曲霉提取物，对CXCL16敲除小鼠和野生型小鼠进行哮喘气道炎症诱导。高通量芯片测序用于筛选各组肺组织中lncRNA和mRNA表达谱的差异。通过基因本体论（GO）和京都基因与基因组百科全书（KEGG）途径富集分析构建lncRNA-mRNA共表达网络。野生小鼠腹腔注射CXCL16中和抗体，采用RT-PCR和ELISA验证生物信息学和炎症结果。

结果：与野生小鼠比较，CXCL16敲除小鼠肺组织 120个lncRNA和388个mRNA上调，1984个lncRNA和301个mRNA下调。构建的lncRNA-mRNA共表达网络包括244个差异表达的lncRNAs和49个差异表达mRNA。其中，中枢基因Idh1和前四种lncRNAs的核心网络表达在CXCL16中和抗体哮喘模型中得到了验证。

结论：对lncRNA-mRNA共表达网络的全面生物学分析探索了关键基因和途径，为理解其机制和发现烟曲霉诱导哮喘的新靶点提供了新的见解。共表达网络中四种差异表达的关键lncRNAs（NONMMUT026034、NONMMUT028184、NONMMUT 016537和NONMMUT043155）可以作为CXCL16分子调控小鼠哮喘模型抗原呈递的干预靶点。

关键词：长链非编码RNA，CXCL16，抗原呈递，共表达网络，哮喘