研究背景：未分化甲状腺癌（Anaplastic Thyroid Carcinoma，ATC）患者的治疗主要包括手术、化疗和放疗，但对提高患者的生存率几乎没有帮助。我们通过对微阵列数据集进行生物信息学分析，研究 ATC 与正常甲状腺的差异表达基因（Differential Expressed Genes，DEGs），寻找 ATC 新的潜在治疗靶点。
研究方法：从 GEO（Gene Expression Omnibus）数据库中下载了五个芯片：GSE9115、GSE29265、GSE33630、GSE53072 和 GSE65144。采用 GEO2R 分析，以 |logFC|>l，p<0. 05 为条件筛选各个芯片中的差异基因。应用 STRING 数据库对 DEGs (综合分 >0.4 分) 构建蛋白互作网络图（Protein-Protein Interaction，PPI），再根据筛选条件通过 Cytoscape 软件筛选出关键基因并将其可视化。最后，利用 Kaplan-Meier Plotter 从这些关键基因中筛选出新的 ATC 基因，并用 RT-qPCR 进行验证。
研究结果：通过上述方法，我们得到 284 个重合的差异基因，其中有 121 个基因的表达是上调的，有 161 个基因的表达下调。应用 STRING 数据库筛选出 232 个 DEGs，通过 Cytoscape 软件将其可视化后，根据筛选条件从 PPI 网络图中得出 50 个核心基因。用 Kaplan-Meier Plotter 对这 50 核心基因进行生存分析，筛选出有 5 个 mRNA 高表达的核心基因与患者总的生存率有明显的负相关性，如 ANLN ，CENPF ，KIF2C ，TPX2 ，NDC80 。最后，RT-qPCR 实验结果表明，KIF2C  和 CENPF  在 ARO 细胞和 CAL-62 细胞中显著上调，TPX2  仅在 CAL-62 细胞中上调，而 ANLN  和 NDC80  在 ARO 细胞和 CAL-62 细胞中的表达明显降低。
研究结论：我们的研究表明 CENPF 、KIF2C  和 TPX2  可能在 ATC 的发生发展中起着重要作用，它们作为 ATC 治疗的潜在生物标志物需要进一步的研究。
关键词：未分化甲状腺癌，生物信息学分析，GEO 数据库，差异表达基因