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CCNB2、CDC20、AURKA、TOP2A、MELK、NCAPG、KIF20A、UBE2C、PRC1 和 ASPM 可能是肝细胞癌的潜在治疗靶点:运用综合生物信息学分析

 

Authors Yang Z , Wu X, Li J, Zheng Q, Niu J, Li S

Received 15 October 2021

Accepted for publication 9 December 2021

Published 22 December 2021 Volume 2021:14 Pages 10185—10194

DOI https://doi.org/10.2147/IJGM.S341379

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Editor who approved publication: Dr Scott Fraser

背景:肝细胞癌(HCC)是一种高度恶性、复发性和耐药性的肿瘤,患者在确诊时往往失去手术机会。基因表达异常与 HCC 的发生密切相关。本研究的目的是确定 HCC 样本的肿瘤组织和非肿瘤组织之间的差异表达基因 (DEGs),以研究肝癌的机制。
方法:从基因表达综合 (GEO) 下载基因表达谱 (GSE62232GSE89377 GSE112790),并使用在线工具 GEO2R 进行分析以鉴定差异表达基因 (DEG)。使用注释、可视化和集成发现数据库进行基因本体论 (GO) 功能和京都基因和基因组百科全书 (KEGG) 通路富集分析。基于用于检索相互作用基因数据库的搜索工具分析这些差异表达基因的蛋白质 - 蛋白质相互作用(PPI),并通过 Cytoscape 软件进行可视化。此外,我们使用在线 Kaplan-Meier 绘图仪生存分析工具来评估中枢基因表达的预后价值。 HPA数据库用于揭示hub基因蛋白质水平的差异。
结果:共鉴定出 50 个上调的 DEG 122 个下调的 DEG。从其中挑选出 10 个连接度高的枢纽基因,结果提示这些枢纽基因的过度表达与 HCC 的不良预后相关。
结论:我们的研究表明,与正常肝组织相比,CCNB2CDC20AURKATOP2AMELKNCAPGKIF20AUBE2CPRC1 ASPM HCC 中过表达。这些基因的过度表达是 HCC 患者的不良预后因素。需要进一步深入研究以探讨它们在 HCC 诊断和治疗中的价值。
关键词:肝细胞癌,枢纽基因,表达谱数据,蛋白质-蛋白质相互作用网络