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演讲嘉宾:

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Department of Chemical Engineering
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DSG3 和 KRT14——区分肺腺癌和肺鳞癌

 

Authors Dong Y, Li S, Sun X, Wang Y, Lu T, Wo Y, Leng X, Kong D, Jiao W

Received 10 July 2020

Accepted for publication 8 September 2020

Published 29 October 2020 Volume 2020:13 Pages 11111—11124

DOI https://doi.org/10.2147/OTT.S270398

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Editor who approved publication: Dr Federico Perche


背景:肺腺癌和肺鳞癌是非小细胞肺癌的主要组织学表型。本文分析了区分肺腺癌和肺鳞癌的目的基因及其潜在相关的肿瘤发生机制。
方法:本研究是从 GEO 数据库下载的两个微阵列数据集(GSE28571 和 GSE10245)的基因展开。通过 GO 和 KEGG 对两个数据集的肺腺癌和肺鳞状细胞癌之间的差异表达基因进行了功能分析。此外,蛋白质-蛋白质相互作用网络用于筛选目的基因。 R 4.0.2 用于通过分析 TCGA 数据库中 DSG3 和 KRT14 的基因表达数据和临床数据来进行 Kaplan-Meier 分析。
结果:在我们的研究中确定了两个数据集共有的 47 个差异基因。功能分析发现差异基因主要与 p63 转录因子以及靶向 TAp63 的转录因子等信号通路有关。分析最终确定了 DSG3 和 KRT14 为区分肺腺癌和肺鳞癌的潜在生物标志物。这些结果表明,DSG3 和 KRT14 可能作为诊断标志物在非小细胞肺癌患者中发挥重要作用。我们也在组织中验证了 DSG3 和 KRT14 的表达量在肺鳞癌中是相对较高的。同时,DSG3 和 KRT14 预示肺鳞癌患者预后较差。根据生物信息学分析,其可能与 TRAIL 信号通路和 TNF 受体信号通路相关。
结论:我们发现 DSG3 和 KRT14 可能作为诊断标志物,用于区分非小细胞肺癌患者中的肺腺癌和肺鳞癌患者。
Keywords: lung adenocarcinoma, lung squamous cell carcinoma, biomarker, distinguishing