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宏基因组下一代测序与传统微生物学检测相比在外周肺感染中的应用价值

 

Authors Huang J, Jiang E, Yang D, Wei J, Zhao M, Feng J, Cao J

Received 18 October 2019

Accepted for publication 24 January 2020

Published 19 February 2020 Volume 2020:13 Pages 567—576

DOI https://doi.org/10.2147/IDR.S235182

Checked for plagiarism Yes

Review by Single-blind

Peer reviewer comments 2

Editor who approved publication: Dr Joachim Wink

目的:本研究通过将支气管镜检查获得的介入标本进行宏基因组一代测序mNGS)分析和传统病原检测,评估 mNGS 外周肺部感染中的诊断价值。
方法:本研究纳入了 2018 年 月至 2019 年 就诊于天津医科大学总医院的疑似肺感染的 240 患者。支气管镜检查获得介入标本行 mNGS 分析和传统病原检测(包括支气管肺泡灌洗液微生物培养,涂片显微镜检查,以及肺活检组织病理学),并比较了 mNGS 和传统方法的诊断率,以评估 mNGS 外周肺感染诊断中的价值。
结果:研究中,将 mNGS 传统病原体检测进行比较,得到如下结论,第一,在肺部感染的患者中,mNGS 可以识别近 89% 的病原。第二,在传统病原检测结果为阴性的肺感染患者样本中,有 94.49% 的 mNGS 检测到了与人类疾病相关的微生物;第三,mNGS 的准确性和敏感性高于传统病原检测。最后,mNGS 可以同时检测和识别多种病原体。
结论:mNGS 可快速、较准确的获得病原学信息,为患者下一步的治疗方案提供病原学依据,特别是对于危重症患者的治疗争取了宝贵的时间。
Keywords: pulmonary infection, metagenomic next-generation sequencing, bronchoscopy, bronchoalveolar lavage, smear microscopy, transbronchial lung biopsy




Figure 2 The bar chart shows the comparison of positive results between...